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PCR是分子生物學(xué)研究和實(shí)驗的常規方法,廣泛應用于生物學(xué)各個(gè)領(lǐng)域,例如:艾滋病檢測、乙型肝炎、禽疫病、癌基因的檢測和診斷,DNA指紋、個(gè)體識別、親子鑒定及法醫物證,動(dòng)、植物檢疫,動(dòng)物及其衍生產(chǎn)品檢測,動(dòng)物飼料、化妝品、食品衛生檢測,轉基因作物與轉基因微生物檢測等。PCR實(shí)驗室即基因擴增實(shí)驗室,PCR實(shí)驗室的分區規劃怎么做?PCR實(shí)驗室的建設設計要點(diǎn)有哪些?PCR實(shí)驗室必須是單向走廊嗎?走廊和傳遞窗是不是標配?就以上PCR實(shí)驗室相關(guān)問(wèn)題,上海CEIDI西遞做了相關(guān)資料整理如下 :
一、PCR基因擴增實(shí)驗室建設設計要點(diǎn)
1. PCR基因擴增實(shí)驗室可以是分散形式,也可以是組合形式。完成一組PCR實(shí)驗,通常應經(jīng)過(guò)試劑配制、樣品處理、核酸擴增及產(chǎn)物分析四個(gè)實(shí)驗過(guò)程,若實(shí)驗工藝需要,還應增加樣品粉碎過(guò)程。
①分散形式PCR實(shí)驗室:
所謂分散形式PCR實(shí)驗室,是指完成上述實(shí)驗過(guò)程的實(shí)驗用房彼此相距較遠,呈分散布置形式。對于這種布置形式的PCR實(shí)驗室建設設計,由于各個(gè)實(shí)驗之間不易相互干擾,因此無(wú)需特殊條件要求。
②組合形式PCR實(shí)驗室:
所謂組合形式PCR實(shí)驗室, 是指完成PCR四個(gè)實(shí)驗過(guò)程的實(shí)驗用房相鄰布置,組成獨立實(shí)驗區域的形式。對于組合形式PCR實(shí)驗室的建設設計,由于各個(gè)實(shí)驗間集中布置,容易造成相互干擾,因此,對總體布局以及屏障系統具有一定的要求。各室在入口處設緩沖間,以減少室內外空氣交換。
二、CEIDI西遞 PCR基因擴增實(shí)驗室設計裝修經(jīng)驗補充
①試劑配制室及樣品處理室宜呈微正壓,以防外界含核酸氣溶膠的空氣進(jìn)入,造成污染;可以通過(guò)控制進(jìn)風(fēng)風(fēng)量大于排風(fēng)風(fēng)量達到正壓效果。
②核酸擴增室及產(chǎn)物分析室應呈微負壓,以防含核酸的氣溶膠擴散出去污染試劑與樣品,可以通過(guò)控制排風(fēng)風(fēng)量大于進(jìn)風(fēng)風(fēng)量達到負壓效果。
③在理想情況下,PCR實(shí)驗室緩沖間內,可設置正壓,使室內空氣不流向室外,室外空氣不流向室內。PCR實(shí)驗室進(jìn)風(fēng)由原有中央空調控制,要求將中央空調風(fēng)口安裝到指定位置,且高度為地面鋪裝好后2600mm處。
④如果使用熒光PCR儀,擴增室和產(chǎn)物分析室可以合并。若房間進(jìn)深允許,可設PCR內部專(zhuān)用走廊。需要指出的是在減少室內外空氣交換方面,緩沖間比專(zhuān)用走廊更有意義。
5. 各個(gè)區域之間應具備單向的實(shí)驗工藝流、物流、人流與氣流,形成單向流程的保護屏障,避免實(shí)驗之間的相互干擾,防止核酸氣溶膠對實(shí)驗過(guò)程造成污染產(chǎn)生假性結果。
6. 實(shí)驗室的墻體,包括頂棚,應結構牢固、氣密性好;所有陰角宜采用圓弧形線(xiàn)條過(guò)渡;墻體內壁光潔、不吸附、耐腐蝕、易清洗消毒;地面材料應滿(mǎn)足無(wú)縫隙、無(wú)滲漏、光潔、耐腐蝕的要求。
三、PCR基因擴增實(shí)驗室設計裝修必須是單向走廊嗎?走廊和傳遞窗是標配嗎?
PCR實(shí)驗室裝修設計是一個(gè)考驗專(zhuān)業(yè)性的設計裝修項目,西遞發(fā)現許多公司在進(jìn)行設計時(shí)喜歡誰(shuí)設置PCR走廊,但其實(shí)PCR走廊對于實(shí)驗室裝修設計來(lái)說(shuō)并不是標配,尤其在建筑進(jìn)深不夠的時(shí)候千萬(wàn)不要硬做PCR走廊。(PCR實(shí)驗室裝修必須是單向走廊嗎?)且PCR走廊會(huì )增加交叉污染,如下即為錯誤范例:
傳遞窗的本質(zhì)則同緩沖間,是物流的緩沖間。傳遞窗并非必須設置,但一般實(shí)驗機構和實(shí)驗人員為便于操作都喜歡設傳遞窗,其實(shí)只要不涉及潔污分流就不需要設傳遞窗,如下圖某實(shí)驗建設單位設置的傳遞窗。
四、PCR實(shí)驗室的功能分區
1. PCR實(shí)驗室的設計通常有四大分區:試劑儲存和準備區、標本制備區、核算擴增區、產(chǎn)物分析區。這四個(gè)分區原本就不需要連接在一起,且在物理空間上必須是獨立的,各區域無(wú)論在空間上還是在使用中,應處于分隔狀態(tài),不能有空氣的直接相通。
2. PCR實(shí)驗室的功能區分布:
① PCR的用房分區可分散布置,可集中布置;集中布置的分布原則是依次排列、獨立分區;4個(gè)基本分區可根據需要進(jìn)行遞增/減。如下為PCR實(shí)驗室功能分區的常見(jiàn)布局
② 建筑上,緩沖間是阻隔空氣交換的首要措施
③ 進(jìn)入工作區域應嚴格按照單一方向進(jìn)行,即:試劑儲存和準備區——標本制備區——核算擴增區——產(chǎn)物分析區
3. PCR實(shí)驗室功能區的壓力控制:
① 壓力梯度在10Pa及以上
② 兩種控制方式:系統控制和排風(fēng)功率變化。系統控制即4個(gè)房間的壓力控制應同時(shí)啟停;排風(fēng)控制即排風(fēng)管道應分支,否則實(shí)驗室停運時(shí)風(fēng)流倒灌,造成污染。
五、PCR基因擴增實(shí)驗室的主要設備
①試劑準備區:儀器設備主要有冰箱、超凈臺、加樣器、混勻器、天平和離心機等,加樣器、天平除了要專(zhuān)用外,還應有定期校準。試劑分裝應在超凈臺中進(jìn)行,擴增反應混合液應使用分子生物學(xué)級的,試劑制備好后應有質(zhì)檢:一是否有污染、二是檢測試劑的擴增效果。如下為PCR實(shí)驗室的試劑準備和儲存區:
②標本制備區:儀器設備主要有生物安全柜、加樣器、離心機、溫育儀、混勻器等。如下為PCR實(shí)驗室的標本制備區
③擴增區:主要儀器是核酸擴增儀、超凈臺、微量加樣器、離心機、可移動(dòng)紫外燈。擴增儀需進(jìn)行校準。并配備UPS電源,以防止由于電壓的波動(dòng),停電對擴增效果的影響。如下為PCR實(shí)驗室擴增反映混合物配制和擴增區:
④分析區:主要儀器設備有酶標儀、洗板機、加樣器和水浴箱等 潔凈實(shí)驗區的緩沖間部分面積不能超過(guò)主實(shí)驗室的八分之一,這是有規定的。如下為PCR實(shí)驗室擴增產(chǎn)物分析區
六、PCR基因擴增實(shí)驗室裝修工程的通風(fēng)系統、壓力控制、污染預防、安裝條件
1.實(shí)驗室空調通風(fēng)系統設計及壓力控制:
PCR實(shí)驗室并沒(méi)有嚴格的凈化要求,但是為避免各個(gè)實(shí)驗區域間交叉污染的可能性,宜采用全送全排的氣流組織形式。同時(shí),要嚴格控制送、排風(fēng)的比例以保證各實(shí)驗區的壓力要求。
2.污染的預防與控制:
PCR實(shí)驗室設計的核心問(wèn)題是如何避免污染。在實(shí)際工作中,常見(jiàn)的有以下幾種污染類(lèi)型:擴增產(chǎn)物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標本間的污染。由于一旦發(fā)生污染,實(shí)驗就必須停止,直到找到污染源為止,而且實(shí)驗結果必須作廢,需重新進(jìn)行實(shí)驗。所以發(fā)生污染后再?lài)@實(shí)驗室來(lái)尋找污染源不但耗時(shí)而且繁瑣,浪費人力物力。因此要避免污染,首先應是預防,而不是排除。
3. 嚴格按照規范科學(xué)設計的安裝流程:
安裝前需要確定以下安裝條件,如:電源電壓,電源進(jìn)線(xiàn)位置,電話(huà)網(wǎng)絡(luò )線(xiàn)進(jìn)線(xiàn)位置,進(jìn)水水壓,安裝空間,地面平整度,通風(fēng)孔、進(jìn)水管和下水管的位置等,理想狀態(tài)的空間尺寸和通風(fēng)口尺寸。
七、CEIDI西遞PCR基因擴增實(shí)驗室建設案例
CEIDI西遞,專(zhuān)業(yè)提供千級至三十萬(wàn)級標準潔凈工程的設計、施工安裝一站式服務(wù),以高質(zhì)量的工程建設和服務(wù)品質(zhì),承建了國內數百家企業(yè)的凈化室車(chē)間、無(wú)塵廠(chǎng)房、潔凈實(shí)驗室工程。擁有國家設計與施工二級資質(zhì)、凈化工程設計與施工一級資質(zhì)環(huán)保一級資質(zhì)、機電安裝三級資質(zhì)、鋼結構三級資質(zhì)、環(huán)保三級資質(zhì)。西遞過(guò)往PCR基因擴增實(shí)驗室建設案例如——上海方達醫藥研發(fā)GMP實(shí)驗室裝修工程。
2019年1月8日,CEIDI西遞與方達醫藥完成設計簽約,2019年1月30日完成施工簽約,并于2019年年初動(dòng)工,全面開(kāi)展位于軍事醫學(xué)科學(xué)院張江研發(fā)中心的Lab+Office裝修項目(上海市浦東新區張衡路1227號一、二樓實(shí)驗室)。方達醫藥是全方位一體化的醫藥研發(fā)合同研究組織(CRO),于2006年增設方達醫藥技術(shù)(上海)有限公司,是中國按照美國FDA標準建立和運營(yíng)的GLP實(shí)驗室。